齊魯工業大學（山東省科學院）現有計算機科學與技術學部（山東保密學院）、輕工學部（生物基材料與綠色造紙國家重點實驗室）、機械工程學部、電子電氣與控制學部、生物工程學部、食品科學與工程學部、環境科學與工程學部、化學與制藥學部、材料科學與工程學部、數學與人工智能學部、光電科學與技術學部、能源與動力工程學部、海洋技術科學學部、菏澤校區（分院）、高新技術產業（中試）基地、前沿交叉學科研究院等16個自然科學類教學、科研單位，教學科研實力雄厚。

學校（科學院）現有國家級平臺10個，其中省部共建國家重點實驗室1個、國家工程技術研究中心1個、國家地方聯合工程實驗室1個、國家超級計算中心1個、國家國際科技合作基地（聯合研究中心）3個、國家技術轉移示范機構2個、國家成果產業化基地1個；省部級重點學科及研究平臺80余個，其中教育部重點實驗室1個、省部共建協同創新中心1個、省實驗室1個、省技術創新中心4個、省重點實驗室16個、省工程實驗室12個、省工程技術研究中心18個、省協同創新中心3個、省級重點學科9個、省高校重點實驗室5個、省產業技術創新戰略聯盟6個、省國際合作研究中心6個，科研平臺建設數量及建設水平位居省內前列。

近年來，學校（科學院）共承擔國家重點研發計劃、“973計劃”“863計劃”、國家自然科學基金、社會科學基金等國家級科研課題605項，省部級項目887項；獲得省部級以上科研獎勵102項，其中獲國家科技進步一等獎1項，國家技術發明二等獎2項，國家科學技術進步二等獎2項，教育部高等學校優秀科研成果獎一等獎1項，中國專利優秀獎4項，山東省科技最高獎1項，山東省技術發明一等獎2項，山東省科技進步一等獎11項, 山東省社科優秀成果一等獎2項，泰山文藝一等獎1項；獲得國家發明專利1400項，山東省專利獎一等獎2項；學術論文被SCI、SSCI收錄2378篇，出版著作174部。主辦《齊魯工業大學學報》《科學與管理》《山東科學》3種學術期刊。 

校（科學院）積極參與國家和山東省發展戰略，面向主導產業發展需求開展科技成果示范推廣和產業化工作，全面服務山東省新舊動能轉換重大工程。近5年，與40多個政府，100多個龍頭企業建立科技合作關系，創辦科技企業70多家，共建科技示范基地30多個,累計創造直接經濟效益1000多億元。被授予中國創新驛站山東區域站點、國家技術轉移示范機構、國家知識產權試點高校、國家級科技合作示范基地、國家級科技成果研究推廣中心、國家級成果產業化基地、山東省產學研合作創新突出貢獻單位等稱號。